发布时间:
2019
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8月1日,BD公司钟星宇博士、许义松博士莅临序科码,指导Rhapsody多样品标记单细胞全转录组测序建库。此次实验共标记4个样品,上样4万个细胞。经过两天的辛勤实验,建库工作顺利完成,质检合格。这也标志着继10X Genomics、单细胞甲基化、单细胞CNV、单细胞ATAC-seq等之后,序科码单细胞阵营再添一员猛将!诺禾致源王忍、雷英彤、黄潇、林绍祥、李航宇,序科码张裕龙、李爽、龙钰垚、谢彩玲、双佩婷、李汶欣、林献威、刘智盛全程参与了实验。BD Rhapsody多样品标记单细胞全转录组测序建库可分为以下几个步骤:(1)样品标记;(2)单细胞分离、细胞裂解、mRNA及样品标签捕获;(3)逆转录、全转录组建库和样品标签建库。 1、样品标记BD Rhapsody通过抗体连接一段带有poly A的samlple tag 单链DNA序列,将样品进行抗体孵育,wash 2-3次(降低背景噪音),随后带poly A的标签和mRNA一起被带有Poly T的磁珠捕获,可最多区分12个样品。 2、单细胞分离、细胞裂解、mRNA及样品标签捕获Rhapsody利用微孔进行单细胞分离,属于Microwell-seq。超过20万个微孔的尺寸被设计成一个微孔恰好可以容纳一个bead(磁珠),bead上连接逆转录引物,引物主要包括以下三个部分:(1)CL(cell label,细胞...
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