发布时间:
2019
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8月1日，BD公司钟星宇博士、许义松博士莅临序科码，指导Rhapsody多样品标记单细胞全转录组测序建库。此次实验共标记4个样品，上样4万个细胞。经过两天的辛勤实验，建库工作顺利完成，质检合格。这也标志着继10X Genomics、单细胞甲基化、单细胞CNV、单细胞ATAC-seq等之后，序科码单细胞阵营再添一员猛将！诺禾致源王忍、雷英彤、黄潇、林绍祥、李航宇，序科码张裕龙、李爽、龙钰垚、谢彩玲、双佩婷、李汶欣、林献威、刘智盛全程参与了实验。BD Rhapsody多样品标记单细胞全转录组测序建库可分为以下几个步骤：（1）样品标记；（2）单细胞分离、细胞裂解、mRNA及样品标签捕获；（3）逆转录、全转录组建库和样品标签建库。 1、样品标记BD Rhapsody通过抗体连接一段带有poly A的samlple tag 单链DNA序列，将样品进行抗体孵育，wash 2-3次（降低背景噪音），随后带poly A的标签和mRNA一起被带有Poly T的磁珠捕获，可最多区分12个样品。 2、单细胞分离、细胞裂解、mRNA及样品标签捕获Rhapsody利用微孔进行单细胞分离，属于Microwell-seq。超过20万个微孔的尺寸被设计成一个微孔恰好可以容纳一个bead（磁珠），bead上连接逆转录引物，引物主要包括以下三个部分：（1）CL（cell label，细胞...
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