类别说明
通过对单个细胞的mRNA进行逆转录和PCR扩增,使用高通量测序手段,对单细胞中mRNA进行基因表达定量、功能富集、代谢通路等分析。它可以解决传统RNA定量技术在早期胚胎发育、干细胞、癌症、免疫等研究领域中存在的样品量极低或细胞异质性的问题,是在单细胞水平研究基因表达强有力的工具,极大地拓展了RNA-Seq的应用范围。
目前,在需要进行较大量的单细胞分析的情况下,10X Genomics 是单细胞RNA测序的最佳手段。它实际上是一种基于Drop-seq及微流体技术的一种高通量测序。
产品优势:
平行捕获大量单细胞:一次分析100-8000个单细胞,捕获率在50—65%
极低RNA起始量:单个细胞(1-10pg 总 RNA)
高灵敏度:可以检测到90%以上的基因表达
技术重复性好:基因表达一致性超过90%
应用领域:
极微量样品的表达分析(单个细胞)
胚胎早期发育研究
肿瘤细胞异质性研究
免疫细胞群研究
干细胞分化研究
研究内容:
一、标准信息分析
原始数据去除接头序列及低质量reads
测序评估(数据比对统计,reads分布随机性统计等)
差异表达基因分析
GO功能显著性富集分析
Pathway显著性富集分析
主成分分析(5个以上样品)
可变剪切分析
SNP分析
二、定制化信息分析
可结合客户需求,定制信息分析内容