单细胞转录组(scRNA-seq)已取得广泛的应用,但其也存在着局限性,如某些组织制备单细胞悬液时难以解离,可能导致个别细胞丢失,解离过程发生转录偏好,对细胞活力以及大小的严格要求,对于临床样品无法及时处理成单细胞悬液上机等等。单细胞核转录组测序(snRNA-seq)正好克服了这些局限性,直接从冷冻组织中裂解出细胞核,对单个细胞核里的mRNA进行逆转录和PCR扩增。现如今,snRNA-seq已在多种组织类型中得到应用,包括脑、肌肉组织、肝脏、肾脏、血管、胰腺、培养细胞系等。
产品说明
10x Genomics Chromium Single Cell 系列产品同样适用于单细胞核的转录组分析。针对细胞核提取,10x Genomics 开发了相应的试剂盒。细胞经过裂解提核并纯化后可采用10x Chromium Single Cell加载芯片实现单细胞核的捕获,裂解与标记分析。这拓展了10x Genomics Chromium Single Cell产品的使用范围。对单细胞核的分析也同时避免了样本单细胞解离带来的样本偏差。
工作流程
项目优势
1. 组织可为冷冻样本,样本类型大大扩增,开展实验方便。
2. 不需用酶消化,直接提核,减少解离偏倚,不会引入人为的转录偏好。
3. 可用于细胞体积过大以及难以制备单细胞悬液的组织样品。
4. 能够鉴定的细胞类型更加全面和完整。
小鼠神经元单细胞核转录组分析。
肌肉组织单细胞核转录组分析。
脂肪组织单细胞核转录组分析。