单细胞转录组测序（single cell RNA-seq, scRNA-seq），是在单细胞水平对mRNA进行高通量测序的技术。10x Genomics平台，基于微流控、油滴包裹和barcode技术，能够一次性分离500~10000个单细胞，获得每个细胞的3'端转录组信息，有效的解决了组织样本无法破解的细胞异质性难题，有助于发现新的稀有细胞类型，并深入了解细胞生长过程中的表达调控机制。

单细胞转录组（scRNA-seq）已取得广泛的应用，但其也存在着局限性，如某些组织制备单细胞悬液时难以解离，可能导致个别细胞丢失，解离过程发生转录偏好，对细胞活力以及大小的严格要求，对于临床样品无法及时处理成单细胞悬液上机等等。单细胞核转录组测序（snRNA-seq）正好克服了这些局限性，直接从冷冻组织中裂解出细胞核，对单个细胞核里的mRNA进行逆转录和PCR扩增。现如今，snRNA-seq已在多种组织类型中得到应用，包括脑、肌肉组织、肝脏、肾脏、血管、胰腺、培养细胞系等。

       10x单细胞ATAC测序（Singel Cell Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing,scATAC-seq），该技术可进行单细胞染色质易开放区域测序，展示表观遗传学⽅⾯的变化，并深入了解基因调控机制。

       Chromium™单细胞免疫V(D)J分析可在一个样本同时获得单细胞基因5’表达谱、T细胞受体和B细胞免疫球蛋白库的信息，可以结合基因的表达谱和V(D)J数据进行复杂组织样本的适应性免疫应答分析，监测免疫疗法的效果，研究复杂的自身免疫性疾病、传染性疾病和其它免疫疾病。